Αρχέτυπα ονομάζονται στα ελληνικά τα βιβλία των αρχών της τυπογραφίας, που έχουν τυπωθεί μέχρι και το έτος 1500 (incunabula). Η συλλογή αρχετύπων του Ιδρύματος είναι η μεγαλύτερη ιδιωτική στην Ελλάδα.
Έχει συγκροτηθεί με υλικό από τις δύο σημαντικότερες συλλογές του Ιδρύματος, τη Bibliotheca Graeca του Σάκου Οικονομόπουλου και τη συλλογή του Προέδρου του Ιδρύματος Πάνου Λασκαρίδη, και συνεχίζει διαρκώς να εμπλουτίζεται. Η συλλογή αρχετύπων αναδεικνύεται συστηματικά μέσα από περιοδικές εκθέσεις, ερευνητικά προγράμματα, ψηφιακές εφαρμογές, συνέδρια και εκδόσεις.